Al 9-lea Festival anual de genomică și biodate

 

ASML livrează Intel-ului un nou instrument revoluționar de producere a cipurilor – Instrumentul de litografie High-NA necesar pentru nodurile de proces de nouă generație ar putea costa aproximativ 400 de milioane USD

 21 dec 23

Companiile producătoare de siliciu vor trebui să găsească modalități de a depăși 100 de miliarde de tranzistori, având în vedere limitele DUVL. Acolo ar putea fi ideală litografia ultravioletă extremă (EUVL). 

 În 2021, categoria plasmelor produse cu laser a deținut cea mai mare cotă de piață pentru echipamentele de litografie cu ultraviolete extreme. 

 Litografia EUV este cel mai costisitor pas în realizarea microcipurilor avansate care alimentează centrele de date, mașinile și iPhone-urile.

​

 @@@@@@@@@2

 

https://festivalofgenomics.com/london/en/page/home 

 Sponsorizat de NHS, BIOBANK, GENOMICS ENGLAND

 

Al 9-lea Festival anual de genomică și biodate de la Londra, miercuri, 24 ianuarie și joi, 25 ianuarie 2024. Festivalul este întâlnirea anuală pentru întreaga comunitate de genomice și biodate pentru a descoperi, întâlni, învăța și sărbători! Festivalul vă va oferi vorbitori inspiraționali, cele mai recente cercetări și descoperiri clinice, tehnologie de ultimă oră și oportunități incredibile de creare de rețele. Gratuit pentru 90% dintre participanți, Festivalul este conceput pentru a vă ajuta să vă întoarceți la muncă, înarmat cu zeci de idei și contacte noi, dar și pentru a vă menține implicat, entuziasmat și mândru de diferența pe care o fac eforturile dumneavoastră pentru pacienți. Abia așteptăm să vă urăm bun venit la ceea ce promite să fie cel mai mare și mai vibrant festival personal de până acum!

 

 

Clinical Genomics /   Genomica  clinica

 

Artificial Intelligence/ Inteligenţă artificială-

 

 Biodata / Biodate 

Cancer Genomics / Genomica cancerului

 

 RNA Therapeutics / Terapii cu ARN

 
Social Genomics / Genomica sociala 

Epigenetics /  Epigenetica

 

Liquid Biopsy / Biopsie lichida

Gene Editing / Editare de gene

Advanced Sequencing Technologies / Tehnologii de secventiere avansata 

 Drug Discovery & Development / Descoperirea și dezvoltarea medicamentelor

Single-Cell & Spatial Omics / Celula unica si Omics spatiale

Microbiome & Metagenomics /Microbiom și metagenomică

Prenatal Screening/ Screening prenatal 

Multi-Omics / Omicsuri Multiple

Women's Health / Sanatatea femeilor

Newborn Sequencing /Secventierea nou nascutilor 

 

Precision Medicine /Medicina de precizie

Rare Diseases / Boli rare

Proteomics / Proteomica

Mental Health / Sanatate mentala 

 TIME
8:55

Analiza extinsă a datelor NGS în cancerul solid Patrick Tarpey, om de știință clinician principal, Solid Cancer, Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust Sponsorizat de Illumina 10:00 Sănătatea noastră viitoare: o resursă lider mondială pentru genomica populației și cercetarea de prevenire Raghib Ali, Chief Executive Officer, Chief Medical Officer & Principal Investigator, Our Future Health 10:30 Date genomice: de la clinică la cercetare și înapoi Richard Scott, CEO interimar, Genomics England

11:00
MAIN STAGE BIODATA STAGE OTHER STAGE PYRAMID STAGE DISCOVERY STAGE LIVE LOUNGE LABORATORY STAGE OPEN AIR STAGE ACOUSTIC STAGE PARK STAGE NEW STAGE PARTNER STAGE - NHS GENOME DOME
MAIN STAGE BIODATA STAGE OTHER STAGE PYRAMID STAGE DISCOVERY STAGE LIVE LOUNGE LABORATORY STAGE OPEN AIR STAGE ACOUSTIC STAGE PARK STAGE NEW STAGE PARTNER STAGE - NHS GENOME DOME
15:40
MAIN STAGE BIODATA STAGE OTHER STAGE PYRAMID STAGE DISCOVERY STAGE LIVE LOUNGE LABORATORY STAGE OPEN AIR STAGE ACOUSTIC STAGE PARK STAGE NEW STAGE PARTNER STAGE - NHS GENOME DOME
19:15
LUNCH AND LIVE LOUNGE TALKS
Screen4Care EU Project as a
Bridge Between Genomics and
Digital Health
Alessandra Ferlini,
Director of the Medical Genetics
Unit, S. Anna University Hospital
& University of Ferrara and
Honorary Visiting Professor,
University College London
Liz Goodman, Chair of Creative
Technology Innovation,
University College Dublin
DATA INTEGRATION
The National Pathology Imaging
Cooperative: A Programme for
Clinical Deployment and
Research in Digital Pathology,
Including Multimodal Cancer
Research
Daljeet Bansal, Operations
Director, National Pathology
Imaging Cooperative
Charlotte Jennings, Research
Fellow in Digital Pathology,
National Pathology Imaging
Cooperative, Scientific Lead
Multimodal programme,
Genomics England
RNA THERAPEUTICS
More details to be announced
shortly
WORKSHOPMulti-Layered Networks as an
Efficient Way to Integrate and
Interpret Omics Datasets
Tamas Korcsmaros, Senior
Lecturer, Imperial College
London
saRNA Therapeutics – An
Approach to Therapeutically
Upregulate Gene Transcription
Nagy Habib, Professor of
Surgery, Imperial College London
From Patient to Population:
Challenges and Cautions of
Population Genomic Screening
for Cancer
Clare Turnbull, Professor of
Translational Cancer Genetics,
Institute of Cancer Research
Genetics Informs the Birth of a
New Disorder – Postpartum
Psychosis
Arianna Di Florio, Professor,
Cardiff University
GENERATIVE AI & LLMS
Reimagining LLMs for
Healthcare: Experiences and
Insights from Building
Foundation Models for the NHS
Josh Au Yeung, AI Clinical
Research Fellow, Guy's and St
Thomas' NHS Foundation Trust
Zeljko Kraljevic, Research Fellow
in Health Informatics, King's
College London
PRE-NATAL SCREENING
In-silico Biological Discovery with
Large Perturbation Models
Patrick Schwab, Senior Director,
Artificial Intelligence and
Machine Learning, GSK
ROUNDTABLE DISCUSSION:
Tackling Health Inequalities in
Genomics: A Precision Public
Health Priority
Maxine Mackintosh, Programme
Lead Diverse Data, Genomics
England
Muhammad Ayub, Professorial
Research Fellow, UCL
Laura Harris, GWAS Catalog
Coordinator, EMBL-EBI
Sasha Henriques, Principal
Genetic Counsellor, Guy’s and St
Thomas’s NHS Trust
Opeyemi Soremekun, Research
Associate at the Institute of
Translational Genomics,
Helmholtz Zentrum Munich
Veline L'esperance, Senior
Clinical Advisor, NHS Race and
Health Observatory
ROUNDTABLE DISCUSSION
Drinks Reception17:40
ADDRESSING AMR
Using Genomics to Uncover the
Origins of Antibiotic Resistance
During Infections
Craig MacLean, Professor of
Evolution and Microbiology,
University of Oxford
Identifying Virulence and AMR
Genes in Bacteria Using GWAS
Daniel Wilson, Professor,
University of Oxford
Rapid Molecular Diagnostics for
HAP and VAP – What Have We
Learnt from the INHALE Study
Vicky Enne, Senior Research
Fellow, Co-ordinator for INHALE
project, University College
London
PATHOGENS & PUBLIC HEALTH
Pathogen Genomics: A
Revolution in Health Security
Meera Chand, Deputy Director,
UK HSA
Integration of Pathogen
Genomics Data for Health
Protection Practice
Declan Bradley, Deputy Director
of Public Health (Epidemiology),
Queen's University Belfast and
Public Health Agency
Global Genomic Surveillance for
the Control of AMR
David Aanensen, Director of the
Centre for Genomic Pathogen
Surveillance, Oxford Big Data
Institute
Web-Based Multi-Omics
Integration Using the Analyst
Software Suite
Jianguo (Jeff) Xia, Associate
Professor of Bioinformatics and
Big Data Analytics, McGill
University
A UK Platform of Nucleic Acid
Therapies for Rare Disease
Haiyan Zhou, Associate
Professor, University College
London
mRNA Vaccines for Cancer:
Clinical Need, Trials and Future
Perspectives
Victoria Kunene, Medical
Oncology Consultant and Lead
Investigator, University Hospitals
Birmingham
Functional Genomics in
Oncology Discovery
Euan Stronach, Senior Director,
GSK
Rapid Whole Genome
Sequencing of Critically Ill
Newborns
Emma Baple, Medical Director of
the NHS South West Genomic
Laboratory Hub & Professor of
Genomic Medicine, University of
Exeter Medical School
Andy Parrish, Head of Exeter
Genomics Laboratory &
Informatics Director, NHS South
West Genomics Laboratory Hub
Break
16:10
ADVANCED SEQUENCING TECHNOLOGIES
Updates on Nanopore-Based
High-Quality Assembly,
Applications of Nanopore
Methylation to Primary Cells,
and Direct RNA (+cDNA)
Nanopore Analysis of
Transcripts in Human Cells and
Tissue
Miten Jain, Assistant Profes

 

program   https://evessio.s3.amazonaws.com/customer/7a596267-f9b0-4189-9e56-d93318a7cd91/event/2e9df0ba-8b6d-4da7-9fd8-2261c6ddf93f/media/My_Media/Agenda_at_a_Glance/AAAG_21.12.23_2.pdf

 

 

 

TIMP 8:55 11:00 ETAPA PRINCIPALA ETAPA DE BIODATA ALTĂ ETAPĂ PIRAMIDĂ ETAPA DE DECOPERIRE LIVE LOUNGE ETAPA DE LABORATOR STAGE ÎN AER DESCHIS STAGE ACUSTIC STAGE PARC ETAPA NOUĂ STAGE PARTENER - DOMUL GENOMULUI NHS ETAPA PRINCIPALA ETAPA DE BIODATA ALTĂ ETAPĂ PIRAMIDĂ ETAPA DE DECOPERIRE LIVE LOUNGE ETAPA DE LABORATOR STAGE ÎN AER DESCHIS STAGE ACUSTIC STAGE PARC ETAPA NOUĂ STAGE PARTENER - DOMUL GENOMULUI NHS 15:40 ETAPA PRINCIPALA ETAPA DE BIODATA ALTĂ ETAPĂ PIRAMIDĂ ETAPA DE DECOPERIRE LIVE LOUNGE ETAPA DE LABORATOR STAGE ÎN AER DESCHIS STAGE ACUSTIC STAGE PARC ETAPA NOUĂ STAGE PARTENER - DOMUL GENOMULUI NHS 19:15 PRÂZUL ȘI DISCUȚII LIVE LOUNGE 

 Proiectul Screen4Care UE ca a Pod între genomică și Sănătate digitală

   

Alessandra Ferlini, Director al Geneticii Medicale Unitatea, Spitalul Universitar S. Anna & Universitatea din Ferrara și Profesor invitat onorific, Colegiul Universitar din Londra Liz Goodman, președinte Creative Inovatie tehnologica, Colegiul Universitar din Dublin 

 

 INTEGRAREA DATELOR  

Imagistica Naţională de Patologie Cooperativă: Un program pentru Desfăşurare clinică şi Cercetare în patologie digitală, 

 

 !!!!!!!!!!!!!!!!!!

Patologia digitală integrată la scară: O soluție pentru diagnosticarea clinică și cercetarea cancerului într-un centru medical academic mare 2021 Aug 13

 Obiectiv: Adoptarea pe scară largă a patologiei digitale (DP) încă lipsește, iar exemplele de DP care conectează cazurile de utilizare pentru diagnostic, cercetare și educație lipsesc. Proiectăm o soluție holistică DP într-un centru medical academic mare, integrat omniprezent în fluxurile de lucru clinice; aplicații de cercetare, inclusiv baze de date moleculare, genetice și tisulare; și procesele educaționale. Materiale și metode: Am creat un vizualizator integrat, independent de furnizor, pentru revizuirea, adnotarea, partajarea și asigurarea calității diapozitivelor digitale într-un context clinic sau de cercetare. Este primul vizualizator autohton autorizat de aprobarea provizorie a statului New York în 2020 pentru diagnosticul primar și deconectarea de la distanță în timpul pandemiei de COVID-19 (boala coronavirus 2019). Introducem în continuare un Broker Onest pentru Tehnologia Bioinformatică (HoBBIT) interconectat pentru a compila și a partaja sistematic seturi de date de cercetare DP la scară largă, inclusiv imagini anonimizate, rapoarte de patologie redactate și date clinice ale pacienților cu consimțământ. Rezultate: Soluția a fost utilizată operațional timp de 3 ani de 926 de patologi și cercetători care au evaluat 288 903 de lame digitale. Un total de 51% dintre acestea au fost revizuite în decurs de o lună de la scanare. Integrarea perfectă a vizualizatorului în 4 sisteme de spital crește în mod clar adoptarea DP. HoBBIT are un impact direct asupra traducerii cunoștințelor în patologie în noi măsuri eficiente de sănătate, inclusiv modele de detecție bazate pe inteligența artificială pentru cancerul de prostată, carcinomul bazocelular și metastazele cancerului de sân, dezvoltate și validate pe mii de cazuri. Concluzii: Evidențiem provocările majore și lecțiile învățate atunci când trecem la digital pentru a oferi orientare pentru alți patologi. Construirea de soluții interconectate nu numai că va crește adoptarea DP, dar va facilita și patologia computațională de generație următoare la scară pentru cercetarea îmbunătățită a cancerului. Cuvinte cheie: inteligență artificială; patologia computațională; patologie digitală; broker cinstit, patologie; imagistica întregului diapozitiv.

 

 

Învățarea automată- Machine learning--de exemplu, îi ajută pe clinicieni să prezică ce tratamente ar putea avea succes În 2019, piața globală a patologiei digitale valora 767 de milioane de dolari. Experții financiari prevăd o rată de creștere anuală compusă de aproape 12% între 2020 și 2027. Această rată este mai mare decât cea a majorității industriilor.

 Rolul AI în telepatologie Telepatologia permite transferul de la distanță a datelor imagistice patologice. Patologii pot face schimb de înregistrări și imagini digitale pentru cercetare și diagnostic în câteva minute. AI completează această tehnologie, permițând un diagnostic mai precis.

 

!!!!!!!!!!!!!!!!!!

 

 

 

 Inclusiv cancerul multimodal Cercetare Daljeet Bansal, Operațiuni Director, Patologia Națională Cooperativă de imagistică Charlotte Jennings, Cercetare Fellow în patologie digitală, Imagistica Nationala de Patologie Cooperative, conducător științific program multimodal, Genomica Anglia  

ARN THERAPEUTICS Mai multe detalii urmează să fie anunțate pe scurt 

 

 ATELIER Rețele multistrat ca și Mod eficient de integrare și Interpretați seturile de date Omics Tamas Korcsmaros, Senior Lector, Colegiul Imperial Londra saRNA Therapeutics – An Abordarea terapeutică Upregulate transcrierea genelor Nagy Habib, profesor de Chirurgie, Colegiul Imperial din Londra De la pacient la populație: Provocări și precauții ale Screeningul genomic al populației pentru Rac Clare Turnbull, profesor de Genetica translațională a cancerului, Institutul de Cercetare a Cancerului Genetica informează nașterea unui Noua tulburare – postpartum Psihoză Arianna Di Florio, profesor, Universitatea Cardiff 

 

 AI GENERATIVE și LLMS Reimaginarea LLM-urilor pentru Asistență medicală: experiențe și Perspective din clădire Modele de fundație pentru NHS Josh Au Yeung, AI Clinical Cercetare, Guy's și St Trustul Fundației NHS al lui Thomas Zeljko Kraljevic, cercetător în Informatică de Sănătate, King's Colegiul din Londra  

SCREENING PRENATAL In-silico Descoperire biologică cu Modele cu perturbații mari Patrick Schwab, director principal, Inteligența artificială și Învățare automată, GSK DISCUȚIE DE LA MASĂ ROTUNDĂ: Abordarea inegalităților în sănătate în Genomica: un public de precizie Prioritate de sănătate Maxine Mackintosh, Program Conduceți diverse date, genomică Anglia Muhammad Ayub, profesor Cercetare, UCL Laura Harris, Catalog GWAS Coordonator, EMBL-EBI Sasha Henriques, director Consilier genetic, Guy’s și St Trustul NHS al lui Thomas Opeyemi Soremekun, Cercetare Asociat la Institutul de Genomica translațională, Helmholtz Zentrum München Veline L'esperance, senior Consilier clinic, NHS Race și Observatorul Sănătăţii DISCUȚIE LA MASĂ ROTUNDE Recepție cu băuturi17:40 Adresându-se AMR Folosind genomica pentru a descoperi Originile rezistenței la antibiotice În timpul infecțiilor Craig MacLean, profesor de Evoluție și microbiologie, Universitatea din Oxford Identificarea virulenței și AMR Genele în bacterii folosind GWAS Daniel Wilson, profesor, Universitatea din Oxford Diagnosticare Moleculară Rapidă pentru HAP și VAP – Ce avem Învățat din studiul INHALE Vicky Enne, cercetare senior Fellow, Coordonator pentru INHALE proiect, Colegiul Universitar Londra PATOGENI ȘI SĂNĂTATE PUBLICĂ Genomica agenților patogeni: A Revoluție în securitatea sănătății Meera Chand, director adjunct, UK HSA Integrarea agentului patogen Date genomice pentru sănătate Practică de protecție Declan Bradley, director adjunct de Sănătate Publică (Epidemiologie), Universitatea Queen din Belfast și Agenția de Sănătate Publică Supravegherea genomică globală pentru controlul AMR David Aanensen, director al Centrul pentru patogeni genomici Supraveghere, Oxford Big Data institut Multi-Omics bazat pe web Integrare folosind analistul Suita de software Jianguo (Jeff) Xia, asociat Profesor de Bioinformatică și Big Data Analytics, McGill Universitate O platformă britanică de acid nucleic Terapii pentru boli rare Haiyan Zhou, asociat Profesor, Colegiul Universitar Londra Vaccinuri ARNm pentru cancer: Nevoia clinică, studiile și viitorul Perspective Victoria Kunene, Medical Consultant oncologic și lider Investigator, Spitale Universitare Birmingham Genomica funcțională în Descoperirea Oncologiei Euan Stronach, director principal, GSK Genom rapid întreg Secvențierea bolilor critice Nou-născuți Emma Baple, director medical al NHS South West Genomic Centrul de laborator și profesor de Medicină Genomică, Universitatea din Facultatea de Medicină din Exeter Andy Parrish, șeful Exeter Laboratorul de genomică și Director de informatică, NHS South Centrul Laboratorului de Genomică de Vest Pauză 

 

 16:10 TEHNOLOGII AVANSATE DE SECVENȚARE  

Actualizări pe baza de Nanopore  

Asamblare de înaltă calitate,  

Aplicații ale lui Nanopore  

Metilarea la celulele primare, și ARN direct (+ADNc) Analiza nanoporilor 

 Transcrieri în celule umane și Țesut Miten Jain, prof. asistent

​

 16:10 ADVANCED SEQUENCE TECHNOLOGIES Updates based on Nanopore High quality assembly, Applications of Nanopore Methylation in primary cells, and direct RNA (+cDNA) Nanopore analysis Transcripts in Human Cells and Tissue Miten Jain, Assistant Prof ​

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4547472/

The human transcriptome across tissues and individuals

 de tradus neaparat

 

De la Wikipedia, enciclopedia liberă Transcriptomul este ansamblul tuturor transcriptelor de ARN, incluzând codificarea și necodificarea, la un individ sau o populație de celule. Termenul poate fi, de asemenea, uneori folosit pentru a se referi la toate ARN-urile sau doar ARNm, în funcție de experimentul particular. Termenul transcriptom este un portmanteau al cuvintelor transcript și genom; este asociat cu procesul de producere a transcripției în timpul procesului biologic de transcriere. Stadiile incipiente ale adnotărilor transcriptomului au început cu bibliotecile de ADNc publicate în anii 1980. Ulterior, apariția tehnologiei de mare debit a condus la modalități mai rapide și mai eficiente de obținere a datelor despre transcriptom. Două tehnici biologice sunt utilizate pentru a studia transcriptomul, și anume microarray ADN, o tehnică bazată pe hibridizare și ARN-seq, o abordare bazată pe secvență.[1] ARN-seq este metoda preferată și a fost tehnica transcriptomică dominantă din anii 2010. Transcriptomica cu o singură celulă permite urmărirea modificărilor transcriptului în timp în interiorul celulelor individuale. Datele obținute din transcriptom sunt folosite în cercetare pentru a obține o perspectivă asupra proceselor precum diferențierea celulară, carcinogeneza, reglarea transcripției și descoperirea biomarkerilor, printre altele. Datele obținute prin transcriptom își găsesc aplicații și în stabilirea relațiilor filogenetice în timpul procesului de evoluție și a fertilizării in vitro. Transcriptomul este strâns legat de alte domenii de studiu biologice bazate pe ome; este complementar proteomului și metabolomului și cuprinde translatomul, exomul, meiomul și tanatotranscriptomul care pot fi văzute ca unele domenii care studiază tipuri specifice de transcripte ARN. Există relații cuantificabile și conservate între Transcriptom și alte -ome, iar datele Transcriptomics pot fi utilizate eficient pentru a prezice alte specii moleculare, cum ar fi metaboliții.[2] Există numeroase baze de date transcriptom disponibile public

 

 

De ce este important un studiu de transcriptomic? Cuantificarea expresiei diferențiale a genelor în diferite organe, țesuturi și tipuri de celule umane este vitală pentru a înțelege fiziologia umană și boala.

 

Secvențierea transcriptomului este o tehnică care utilizează tehnologii de secvențiere de mare performanță pentru a obține acces la aproape toate transcrierile de țesuturi sau celule specifice într-o anumită stare prin secvențierea ADNc 

 

 

=În genetică, ADN-ul complementar (ADNc) este ADN sintetizat dintr-un ARN monocatenar (de exemplu, ARN mesager (ARNm) sau microARN (miARN)) matriță într-o reacție catalizată de enzima transcriptază inversă. ADNc este adesea folosit pentru a exprima o proteină specifică într-o celulă care nu se exprimă în mod normal=

 

cuprinzătoare și rapidă, devenind baza și punctul de plecare pentru cercetarea expresiei genelor1. . ARN-Seq este o tehnică de secvențiere care utilizează secvențierea de generație următoare (NGS) pentru a dezvălui prezența și cantitatea de ARN într-o probă biologică, reprezentând un instantaneu agregat al grupului dinamic de ARN al celulelor, cunoscut și sub numele de transcriptom2. Analizând întreaga colecție de secvențe de ARN dintr-o celulă (transcriptomul), cercetătorii pot determina când și unde este activată sau dezactivată fiecare genă în celulele și țesuturile unui organism3.

 

 @@@@@@@@

 

Omică spațială: înțelegerea biologiei celulare

 

Ce este Spatial Omics? Organizarea spațială a celulelor în sistemele multicelulare este crucială pentru buna lor funcționare. Eterogenitatea expresiei genelor spațiale, de exemplu, joacă un rol esențial într-o serie de procese biologice, fiziologice și patologice. Analiza rezolvată spațial a transcriptomului are o utilitate largă în cercetarea bolilor umane și a biologiei dezvoltării. Dar de ce termenul „omics” în omică spațială? Omics este un termen generic pentru o serie de analize diferite: genomica epigenomica metabolomica transcriptomica proteomica lipidomice Sufixul „omics” descrie faptul că ceva este analizat. Exemplu: Transcriptomica analizează ARN-ul total. În omica spațială, analiza moleculară este combinată cu informațiile spațiale. Găsiți informațiile spațiale în țesut prin localizarea celulei. Omica spațială va fi o tehnologie crucială pentru înțelegerea proceselor precum reglarea celulelor sau organizarea țesuturilor. 

 

 

 Cancerul în context spațial  

Cercetătorii trebuie să înțeleagă eterogenitatea intratumorală. Cum variază semnăturile moleculare între celulele tumorale? Cartografierea spațială a eterogenității în expresia genelor în țesuturile canceroase ar putea îmbunătăți înțelegerea cancerelor. Ar putea ajuta la detectarea rapidă a cancerelor cu acuratețe și fiabilitate ridicate. Au fost realizate progrese semnificative în ultimii ani în tehnologiile omice, care posedă un potențial puternic de a fi aplicate în cartografierea spațială a probelor de țesut de biopsie și profilarea lor moleculară la nivel de o singură celulă. Secvențierea ARN a arătat noi biomarkeri și regulatori moleculari care au cauzat izbucnirea cancerului. Creșterea tumorii, metastazele și rezistența la medicamente au fost asociate cu acești regulatori moleculari.

in general, obiectivul științelor omice este de a identifica, caracteriza și cuantifica toate moleculele biologice care sunt implicate în structura, funcția și dinamica unei celule, țesuturi sau organism. Așadar, termenul de omică spațială descrie o abordare specifică de omică curentă, oferind în același timp un context spațial valoros prin suprapunerea datelor la nivel omic pe imaginile de țesut. Aceste date ajută la observarea, de exemplu, a diferențelor de distribuție celulară în țesutul bolnav și normal prin aplicarea spațială-omică. Spațial-omics permite, de asemenea, realizarea profilului bimolecular aprofundat, păstrând în același timp morfologia nativă a celulei pentru investigarea interacțiunilor celulă-celulă și celulă-ECM și sunt posibile multe alte investigații. 

 

 Beneficiile utilizării Spatial Omics

​

Generarea atlasului spațial al cancerelor umane în mai multe omice poate îmbunătăți în mod fundamental înțelegerea tumorigenezei, poate deschide revoluția paradigmei cercetării medicale și, în cele din urmă, poate facilita proiectarea de strategii terapeutice avansate în viitorul apropiat. Rezumarea analizei celulelor într-un context spațio-temporal va aduce cercetarea medicală într-o paradigmă cu totul nouă. 

 

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34459502/

Omică cu o singură celulă: prezentare generală, analiză și aplicare în știința biomedicală

Single-cell omics: Overview, analysis, and application in biomedical science

Metodele de secvențiere cu o singură celulă oferă cea mai înaltă rezoluție perspectivă asupra eterogenității celulare. Datorită creșterii lor rapide și a costurilor în scădere, acestea sunt acum accesibile pe scară largă pentru oamenii de știință din întreaga lume. Tehnologiile cu o singură celulă permit analiza unui număr mare de celule, făcându-le instrumente puternice pentru a caracteriza tipurile de celule rare și pentru a ne rafina înțelegerea diferitelor stări celulare. Mai mult, aplicarea unicelulare în științele biomedicale ajută la dezlegarea mecanismelor legate de patogeneza și rezultatul bolii. În acest punct de vedere, descriem pe scurt metodele existente unicelulare (genomică, transcriptomică, epigenomică, proteomică și mulitomică), comentăm instrumentele de analiză disponibile și dăm exemple de aplicații ale metodelor în domeniul biomedical. Cuvinte cheie: bioinformatică; epigenomica; genomica; hematologie; multiomica; proteomica; metode unicelulare; transcriptomica.

​